Touche principalement le blé et l’orge, mais aussi le seigle et l’avoine.

Symptômes
Les infections qui surviennent pendant la floraison interrompent les apports en nutriments, ce qui fait mourir les grains (échaudage, épillets desséchés). Lorsque l’infection se développe plus tardivement, elle entraîne la production de grains ridés. Quand le temps est humide, les champignons du genre Fusarium produisent des sores rougeâtres sur le bord des glumes. Une infestation à F. nivale au niveau des épis peut souvent être détectée à la présence d’un anneau brun diffus à la base des glumes. Les épis ou parties d’épis malades sont ensuite colonisés par des champignons noirs.

Occurrence / importance
Les champignons du genre Fusarium font partie des agents pathogènes les plus dangereux pour les céréales, car ils touchent les épis. La réduction du nombre de grains par épi et la diminution du PMG entraînent des pertes de rendement. Des pertes de qualité sont aussi à déplorer, avec une baisse de la qualité boulangère de la céréale et une baisse de l’efficacité alimentaire due à des rendements en grains et des teneurs en protéines plus faibles, mais aussi aux substances toxiques produites par le champignon (mycotoxines), qui nuisent à la santé de l’homme et de l’animal. F. nivale, parasite des semences le plus fréquent, nuit à la capacité germinative et à la vigueur des graines.

Description
Le phoma est un champignon qui, sur colza, peut entraîner des pertes de rendement de plusieurs quintaux par hectare lorsque l’attaque est forte et précoce. Sa lutte passe principalement par des pratiques culturales appropriées et le choix de variétés tolérantes.

Le phoma se maintient sur les résidus de culture et ne se développe pas en l’absence de lumière. L’enfouissement de ces résidus dès la récolte représente donc la première des pratiques culturales recommandées. Il est ensuite conseillé de limiter les apports d’engrais organiques en été, de privilégier les semis précoces, de semer à moins de 40 graines/m² et d’utiliser des variétés tolérantes, très peu ou peu sensibles.

Suite à des observations de résistance sur des variétés classées tolérantes, Terres Inovia conseille par ailleurs d’alterner l’utilisation de variétés à résistance spécifique Rlm7 et celle d’autres variétés tolérantes. Sur la parcelle et les parcelles voisines.

Symptômes
Le phoma se reconnaît par des taches blanches-grises cendrées appelées macules. Ces taches, qui s’observent sur feuilles dès l’automne puis éventuellement par la suite sur tiges et siliques, sont caractéristiques : à la différence des taches de pseudocercosporella, elles présentent des points noirs, les pycnides.
Dès la sortie de l’hiver, une nécrose peut également être observée au niveau du collet des jeunes pieds. Une nécrose qui provoque un défaut d’alimentation et donc des pertes importantes, voire même des sections de tiges.

Nuisibilité
Si les macules sur feuilles seules n’ont pas d’incidence particulière en terme de rendement, les attaques au niveau du collet peuvent, en revanche, entraîner des pertes de rendement allant jusqu’à 15 q/ha.

Cycle
Le champignon Leptosphaeria maculans se conserve sur les pailles des cultures contaminées. Il y produit des périthèces qui libèrent des ascospores, responsables des contaminations à l’automne. Une contamination qui démarre sur les feuilles et qui se poursuit à l’intérieur de la plante pour apparaître au niveau du collet.

Touche principalement le blé, mais aussi l’orge et le seigle.

Symptômes
Des plaques d’abord farineuses et de couleur blanchâtre, puis duveteuses et brunâtres apparaissent sur les épis. La maladie peut ensuite gagner les épis depuis les étages foliaires supérieurs, mais aussi lors de la dissémination de nouveau matériel infectieux. Les premiers symptômes sont observés sur la face interne des épis qui fait face à la tige. De là, la maladie se répand rapidement pour atteindre aussi la partie inférieure de la tige. La pluie peut laver quelque peu ces taches caractéristiques. On ne constate ensuite plus qu’un brunissement des glumes qui est très semblable aux symptômes de la septoriose (Septoria nodorum).

Occurrence / importance
L’atteinte des épis de blé a principalement un impact négatif sur la qualité des grains. Le PMG est réduit lorsque le métabolisme de la feuille étendard – qui a un impact important sur le rendement – et des glumes est affecté.

Généralités
Il ne se présente plus… Ce serait presque une maladie emblématique des cultures, annuelles comme pérennes. En céréales, il est pourtant qualifié de parasite secondaire. Son impact n’est toutefois pas à sous-estimer, ni son risque, bien plus élevé si la culture de blé ou d’orge est pratiquée sur sols calcaires.

Symptômes
C’est bien le feutrage blanchâtre sur l’envers des jeunes feuilles, apparaissant de la première feuille au début du tallage, qui est si caractéristique de l’oïdium. Par la suite, tous les filaments passent en gris !
Puis, en vieillissant, le champignon produit des périthèces (spores) et des ponctuations noires qui apparaissent sur les feuilles.
Les symptômes disparaissent avec de fortes précipitations, ne laissant ainsi que des taches brunes : dans ces conditions, l’inoculum n’est plus présent sur la feuille.

Cycle
L’oïdium peut se développer précocement si les conditions climatiques sont favorables : hygrométrie nocturne importante (70 à 80 % suffit) et hygrométrie diurne faible.
Les spores, très légères, peuvent être véhiculées par le vent sur de grandes distances. L’oïdium se propage également dès les premiers stades de la culture, par l’intermédiaire des adventices hôtes du pathogène ou à partir de l’inoculum primaire, les ascospores, contenus dans les résidus de culture.
Le mycélium se multiplie rapidement, sans phase d’incubation et produit des spores (conidies) qui germent dès que la température atteint 15 à 20°C.

Généralités
La rouille de l'asperge est un champignon pathogène de toutes les espèces d’asperges, cultivées ou sauvages, ainsi que de l'oignon, de l’échalote et de la ciboulette. En détruisant le feuillage, la rouille empêche la bonne constitution des réserves dans la griffe.

Symptômes
Dès le printemps, la rouille de l'asperge apparaît sur les tiges sous forme de lésions de couleur vert clair. Ces taches sont plutôt ovales et légèrement en relief. Elles se transforment ensuite en pustules pulvérulentes orangées. Pendant l'été, ces pustules noircissent et recouvrent tous les organes de l'asperge. Dans les situations de forte pression, la maladie s’étend aux feuilles. Elles se dessèchent complètement et tombent.

Nuisibilité
Du fait de l’assèchement qui peut être total du feuillage de l'asperge, la rouille ralentit voire bloque la photosynthèse, et en conséquence la formation des sucres et la croissance de la culture. Deux conséquences sont alors très préjudiciables : la baisse importante de la production pour la récolte en cours, et la diminution du stock de réserves pour la récolte suivante. Si les attaques de rouille se succèdent sur plusieurs années, les griffes de l'asperge perdent fortement en vigueur. Les attaques d'aspergeraies par la rouille les plus redoutables sont celles qui surviennent précocement la deuxième année.

Biologie, cycle
Le cycle de développement de Puccinia asparagi comprend plusieurs stades et tous se déroulent sur l'asperge.
Pendant l'hiver, les téliospores survivent sur les débris de culture, puis germent au printemps, laissant apparaitre de petites basidiospores. Ces dernières sont à l’origine de l'infection en étant transportées par le vent sur les turions.
D'avril à juillet, de petites lésions (écidies) naissent à la base des tiges infectées. Ces écidies expulsent des écidiospores qui, lorsque le feuillage est humide, contaminent à nouveau les parties aériennes de l’asperge.
Environ quatorze jours plus tard, de petites boursouflures de couleur brune apparaissent sur les tiges et les feuilles. Ce sont des lésions urédiennes qui s'ouvrent à leur tour et laissent échapper des urédospores de couleur rouille. Ce sont ces dernières spores qui contaminent à nouveau l'asperge pendant l'été et à l'automne, avant de se transformer en télidiospores, lesquelles vont hiver.
Les nuits fraîches accompagnées de rosées, de brume ou de légères précipitations, suivies de températures chaudes rassemblent les conditions idéales pour favoriser les épidémies de rouille de l'asperge.

Généralités
L’eau ferait-elle rouiller les céréales ? En tout cas, c’est un facteur essentiel dans la germination des spores de Puccinia graminis, la rouille des blés. Cette maladie est moyennement nuisible mais trouve un point d’appui, en marge de la culture, dans les graminées adventices ou les repousses de céréales.
La rouille brune nécessite des températures douces pour se développer. Elle est plus présente dans l’Ouest et la moitié Sud de la France et affecte le blé tendre, le blé dur et le triticale. Il existe des années à rouilles, la dernière date de 2007. La maladie avait alors envahi  toutes les régions, même celles du Nord.

Symptômes
La rouille brune provoque, dans un premier temps, l’apparition de petites tâches ovales de chlorose (pustules de rouille brune) sur les feuilles. Ces pustules déchirent la surface foliaire et libèrent une poudre brune (des spores) disséminées par le vent. Selon les circonstances (climat ou résistance variétale), des auréoles chlorotiques peuvent apparaître autour des pustules. En fin d’attaque apparaissent des pustules noires à la place des pustules brunes : c’est la phase sexuée qui débute.

Nuisibilité
Les feuilles sont les principaux organes attaqués. Les gaines le long de la tige sont parfois atteintes, et en cas de très forte infestation, les épis peuvent être touchés. Les pertes dues à la rouille brune sont généralement de l’ordre de 10 %, mais peuvent atteindre 40% en cas de fortes attaques sur des variétés de blés sensibles.

Cycle
La rouille est un pathogène obligatoire. Elle a besoin d’une plante hôte pour survivre et se multiplier. Son cycle comprend une phase sexuée et une phase asexuée. La phase sexuée se déroule sur des hôtes secondaires (adventices, repousses de blé).
Au cours de cette phase le champignon assure sa survie et sa multiplication. Les spores alors produites contamineront les cultures de blé.
La phase asexuée se déroule sur le blé. Les spores germent en présence d’eau libre, et pour des températures comprises entre 15 et 25°C. Le champignon pénètre dans la plante en quelques heures et est capable d’effectuer un cycle complet en 7 à 10 jours, conduisant à la formation de pustules brunes et la libération de spores (urédospores). Ce cycle est plus court (6 jours) si les températures augmentent (> 25°C) pouvant conduire à des attaques explosives. Les cycles s’enchaînent tant que les conditions favorables sont réunies. Les spores alors produites sont dispersées par le vent et contaminent l’ensemble de la parcelle.
C’est lorsque les conditions deviennent défavorables à ces cycles (fin de printemps, été), que des spores qui contamineront les adventices (hôtes secondaires) sont produites. Elle  démarre une nouvelle phase sexuée.

Généralités
C’est surtout sur blé tendre que se retrouve cette maladie des feuilles. Elle est parfois détectée sur le blé dur, l’orge ou le triticale. La rouille jaune n’aime pas le soleil et préfère les printemps frais de la moitié Nord de la France pour se propager.

Symptômes
La rouille jaune provoque dans un premier temps des chloroses à partir desquelles apparaîtront les pustules.
Disposées sous formes de stries linéaires parallèles aux nervures des feuilles, ces pustules libèrent une poudre jaune-orangée (des spores). Ces spores assurent la dissémination locale de la maladie de plante à plante.
Les attaques sévères conduisent à la chlorose et finalement la nécrose des feuilles

Nuisibilité
Les pertes dues à la rouille jaune peuvent affecter 40 % du rendement en cas de fortes attaques sur des variétés de blés sensibles. Cependant un ensoleillement important limite sa nuisibilité car les spores, très sensibles aux rayons ultra-violets, ne survivent pas bien.

Cycle
La rouille jaune est un pathogène obligatoire, nécessitant une plante hôte pour survivre et se multiplier. Elle se développe en condition de forte humidité et à des températures basses, avec un optimum aux alentours de 11°C (min - max : 0°C - 23°C). En hiver, le champignon survit sur les jeunes pousses de blé. Si les conditions le permettent, les premières lésions peuvent apparaître.
Au printemps, avec des températures fraîches et une pluviométrie souvent importante, la rouille jaune trouve les conditions favorables à son développement. Les cycles s’enchaînent : les pustules apparaissent clairement et les spores se dispersent localement, étendant le foyer vers les plantes voisines, jusqu’à la contamination de toute la parcelle.
A la fin de l’été, le champignon démarre son cycle sexué en libérant des spores qui se déposeront localement sur les adventices assurant le rôle d’hôtes secondaires durant une partie de l’automne.

Description
La sclérotiniose est l’une des maladies principales du colza. Elle apparaît surtout lors de printemps doux et humides. Sa fréquence se limite à deux ou trois années sur dix, mais sa nuisibilité se révèle importante, avec des pertes de rendement supérieures à 10 q/ha.

Symptômes
Les symptômes peuvent déjà s’observer à la fin de l'hiver ou à la reprise de végétation, sur les feuilles de la rosette : celles-ci deviennent molles et translucides et se recouvrent d'amas mycéliens blancs le long du pétiole. Ce sont des sclérotes en formation, la forme de conservation hivernale du champignon.

Au printemps, les feuilles en contact avec le sol sont susceptibles d'être infectées et au collet de certaines plantes, un amas mycélien blanc peut témoigner d'une attaque au niveau des racines.

Sur les feuilles, une pourriture grise se développe autour d’un pétale. Lorsque les feuilles sont entièrement contaminées, elles pendent le long de la tige et se dessèchent.

Les tiges, quant à elles, présentent des taches blanches-grises circulaires qui progressent à partir de l’aisselle des feuilles. Cette nécrose interrompt la circulation de la sève et la partie supérieure de la plante échaude.

Les siliques peuvent également être touchées : elles blanchissent et se dessèchent, avec éventuellement une formation de sclérotes

Nuisibilité
En cas d’attaque sur les hampes principales, les dégâts peuvent atteindre, voire dépasser 15 q/ha.

Ces pertes de rendement résultent principalement d'un échaudage qui provoque une réduction du poids de mille grains et un égrenage plus ou moins important selon l’intensité de l’attaque.

Cycle
Le champignon Sclerotinia sclerotiorum se conserve sur et dans le sol sous forme de sclérotes, des amas de mycélium. Ces sclérotes sont capables soit de germer directement sous forme mycélienne, soit de donner naissance à des fructifications appelées apothécies. Ainsi, au printemps, si la température est supérieure à 5°C et l’humidité élevée pendant 10 jours environ, on peut voir apparaître ces apothécies, des bouquets de petits disques beiges au ras du sol qui libèrent des spores dans l’atmosphère. Chaque apothécie peut expulser en quelques jours entre 2 et 30 millions d’ascospores. Véhiculées par les courants d’air, elles atteignent tous les étages foliaires de la culture, sur la parcelle et les parcelles voisines.

Ces spores vont alors contaminer les pétales qui, en tombant, se fixent sur les feuilles et permettent au mycélium de coloniser le limbe de la feuille puis le pétiole, et enfin la tige. Des sclérotes, qui se forment dans les tissus contaminés, vont ensuite tomber au sol à la récolte et s’y conserver pendant 6 à 10 ans. Un nouveau cycle d’épidémie est prêt à repartir.

Symptômes
Des taches en forme de points, de couleur violet brun, peuvent être observées sur les épis de blé, principalement sur la moitié supérieure des glumes. Généralement, seule la partie supérieure de la lemme qui n’est pas recouverte par la glume brunit. Le corps fructifère de l’agent pathogène, sombre en forme de point, apparaît ensuite de manière bien reconnaissable. A la faveur de l’humidité, il libère une gelée sporifère rose en forme de tortillons (pycnospores).

Occurrence / importance
L’agent pathogène joue un rôle important lorsque le temps est chaud et humide. Une contamination des étages foliaires supérieurs et des épis réduit non seulement la surface d’assimilation, mais a aussi pour effet de bloquer les assimilats dans les parties touchées de la plante, ce qui les rend indisponibles pour le remplissage des grains. Le PMG est alors réduit. De plus, le champignon endommage directement la plante hôte en libérant des substances toxiques. La septoriose met davantage en péril les variétés à maturation précoce et à paille courte que les variétés tardives et à paille longue.